BIIGLE4Beginners: Neues Online-Tutorial zur Annotation von Bildern und Videos

Ab sofort können Interessierte Schritt für Schritt und im eigenen Tempo den Umgang mit BIIGLE erlernen. Die kostenfreie Selbstlerneinheit vermittelt den gesamten Annotationsprozess praxisnah anhand realer Beispieldaten.

BIIGLE gehört bereits seit mehreren Jahren zum Serviceportfolio von NFDI4Biodiversity. Der Dienst unterstützt Forschende dabei, Objekte in Bildern und Videos zu annotieren und so statistisch auswertbare, maschinenlesbare Daten für die Biodiversitätsforschung zu gewinnen. Das neue Online-Tutorial "BIIGLE4Beginners" – "BIIGLE für Einsteiger:innen" – bietet nun eine praxisnahe, Schritt für Schritt geführte Einführung in die Software.

Lernen durch Ausprobieren

BIIGLE4Beginners ist ein interaktives Online-Tutorial, das neue Nutzer:innen durch den gesamten Prozess der Bild- und Videoannotation führt – von der Einrichtung eines Benutzerkontos bis zum Export der fertigen Daten. In acht Kapiteln richten die Teilnehmenden ihr BIIGLE-Konto ein, erstellen und verwalten ein Annotationsprojekt, legen ein eigenes Vokabular für die Annotation an und laden Dateien hoch. Anhand praktischer Übungen annotieren sie Bilder und Videos und exportieren anschließend ihre Annotationsdaten.

Das Tutorial arbeitet mit realen Beispieldaten, darunter Einzelbilder und Videoaufnahmen. So entwickeln die Teilnehmenden von Anfang an ein Gespür für den Umgang mit genau den Daten, für deren Bearbeitung BIIGLE konzipiert wurde. Es ist kostenlos über das Training eSupport System (TeSS) der europäischen Forschungsinfrastruktur für Lebenswissenschaften ELIXIR verfügbar: https://tess.elixir-europe.org/materials/biigle-for-beginners

Entwickelt mit Unterstützung von NFDI4Biodiversity

Das Tutorial BIIGLE4Beginners entstand im Rahmen der Aktivitäten von NFDI4Biodiversity zu offenen Bildungsmaterialien (Open Educational Resources, OER). Während der gesamten Entwicklung gab das Team inhaltliches Feedback und brachte bewährte Leitlinien für die Erstellung von OER ein. So entstand ein klar aufgebautes, eigenständig nutzbares Lernmodul, das sich nahtlos in das bestehende Angebot offener Lehr- und Lernmaterialien für die Biodiversitätsforschung einfügt.

Über BIIGLE

BIIGLE ist eine webbasierte Open-Source-Software zur Annotation von Objekten in Bildern und Videos, die an der Universität Bielefeld entwickelt und betreut wird. Die öffentlich zugängliche Instanz auf biigle.de wird von mehr als 6.000 Forschenden in über 40 Ländern genutzt. Sie annotieren damit Aufnahmen aus Meeres- und Landökosystemen ebenso wie Mikroskopiebilder. Bislang sind auf diese Weise mehr als 45 Millionen Annotationen entstanden.

Die Weiterentwicklung von BIIGLE wird vom Bielefelder Institut für Bioinformatik-Infrastruktur (BIBI) und dem Deutschen Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur (de.NBI) unterstützt, die beide Partner des rund 60 Institutionen umfassenden NFDI4Biodiversity-Netzwerks sind. Der Quellcode der Software wird offen auf GitHub weiterentwickelt.