BiodiversiTea – die NFDI4Biodiversity Coffee Lecture #1

Unser neues Austauschformat BiodiversiTea bietet ab April 2024 ein Forum zum Vorstellen und Diskutieren von Arbeiten, Projekten, Tools und Themen aus der und um die NFDI4Biodiversity-Community. Einmal im Monat möchten wir uns online für eine Stunde treffen – für spannende Präsentationen und angeregten Austausch bei einer Tasse Tee (oder Kaffee). Die Runde ist offen für alle, die Lust haben, sich um aktuelle Entwicklungen und Themen rund um Bidoviersitätsdaten zu informieren und auszutauschen. Eine Zugehörigkeit zu NFDI4Biodiversity ist nicht notwendig.

Thema im April 2024
API für die Abfrage von Taxa und Konzeptbeziehungen aus dem Checklisten-System des Bundesamts für Naturschutz (BfN) – eine Kooperation zwischen NFDI4Biodiversity und BfN

Vortragende
Elisabeth Hüllbusch, Bundesamt für Naturschutz (BfN)
Anton Güntsch, Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin

Darum geht es
Biodiversitätsdaten beziehen sich in der Regel auf wissenschaftliche Namen, welche aber oft in verschiedenem taxonomischen Umfang verwendet werden – und somit nicht eindeutig sind. Es ist daher nötig, wissenschaftliche Namen auf einen definierten taxonomischen Umfang oder ein bestimmtes Taxon zu beziehen (sogenannte Annotation). Die Voraussetzung dafür ist, dass Taxa-Daten in Form eines semantischen Netzes vorliegen, in dem die Beziehungen der verschiedenen Taxa und Konzepte untereinander enthalten sind. Das “Checklisten (CL)-System” des Bundesamts für Naturschutz dient bereits als essentielles Werkzeug für die Erfassung und Verwaltung von Pflanzen- und Tierdaten in Deutschland. Dort sind bundesweit abgestimmte Checklisten für über 80 Artengruppen hinterlegt. Konzeptbeziehungen zwischen Taxa zweier Checklisten geben an, wie sich die Taxonkonzepte zueinander verhalten. BfN und NFDI4Biodiversity haben gemeinsam die öffentliche Webschnittstelle “CL-API” entwickelt, die eine Suche nach Namen bzw. Taxa im CL-System sowie eine Abfrage der Konzeptbeziehungen zwischen diesen erlaubt. Auf diese Weise können zu einem Namen mögliche taxonomische Konzepte angezeigt werden und gegebenenfalls kann das passende Konzept ausgewählt und referenziert werden. Die technologische Weiterentwicklung ermöglicht damit einen direkten sowie unkomplizierten Zugang zu den Daten und verbessert die Interoperabilität mit anderen Forschungsdiensten. Im BiodiversiTea wird die Schnittstelle vorgestellt.

Weiterführende Informationen
REST-API
Artikel im NFDI4Biodiversity-Newsblog über die neue Schnittstelle

Fragen & Anregungen

Der BiodiversiTea lebt von euren Ideen! Ihr möchtet Feedback einholen, sucht Mitstreiter, möchtet Arbeitsergebnisse vorstellen oder wollt euch zu einem Thema in größerer Runde austauschen? Schreibt uns an helpdesk@nfdi4biodiversity.org oder über unser Helpdesk-Formular und wir gestalten zusammen eine der kommenden Lectures.

Auch bei Fragen freuen wir uns über eine Nachricht an unseren Helpdesk.

Teilnehmen

Das Meeting wird kurz vor Beginn des Events geöffnet.

Meeting-ID: 695 7025 3689
Kenncode: 384887